اسس قسم النقوش عام 1985 بهدف اعداد مختصين في حقل الكتابات الشرقيه القديمه والقيام على نشر النقوش المكتشفه في الاردن وتهيئه المجال امام الباحثين لدراسة النقوش ، بمضامينها اللغويه والتاريخيه والدينيه والاقتصادية. ويختص القسم بالتدريس في مستوى الدراسات العليا وتشمل دراسة النقوش الشماليه الغربيه والنقوش العربيه الشمالية والجنوبيه والنقوش اليونانيه واللاتينيه .كما يهدف هذا القسم الى الى اعداد مدونه النقوش الاردنيه وتكوين فريق متخصص يقوم بتاسيس ارشيف لكل ما كتب عن النقوش التي وجدت في الاردن .