يعد فرع هندسة المعادن من الفروع المهمة في القسم خصوصا وفي الجامعة عموما وذلك لاهميته في رفد المنشأت الصناعية بالكوادر الهندسية المختلفة والمتخصصة في هذا المجال.حيث تأسس الفرع عام 1980 ويهتم بدراسة الخواص الميكانيكية والميتالورجية للمعادن والسبائك من خلال دراسة التركيب البلوري للمعادن وسبائكها، طرق استخلاصها من خاماتها وطرق تصنيعها باستخدام الطرق المختلفة كاللحام والسباكة والتشغيل والتشكيل واجراء المعاملات الحرارية التقليدية والمتقدمة علاوة الى استخدام الطرق الحديثة في هندسة الاسطح لتحوير ولتغيير في الخواص السطحية للمعادن والسبائك.