تتمثل رؤية الفرع في الوصول الى المراتب العليا في تعليم وتدريس طلبة الدراسات الاولية والعليا في مجال الاحياء المجهرية السريرية لما كونها من تشكيل الكثير من الامراض المعدية والأوبئة العالمية والمسببة للكثير من الوفيات في ظل التغيير والتطور السريع للجراثيم ويبقى العامل الاهم اعداد وتخريج اطباء وباحثين اكفاء على مستوى البلد وضمان ان يكون لهم دور فاعل في مجتمعهم، وتوفير بيئة جيدة للتعليم الذاتي والتدريب على طريق التفكير الابداعي في مجالات الطب.