يسعى الفرع إلى تعزيز الجانب المعرفي لدي الطلبة من خلال مواكبة التطور في المجال المعرفي لعلوم الاحياء المجهرية وبالتالي الارتقاء بمستوى طلبة كلية الطلب البيطري وكذلك إعداد الكوادر بشرية متخصصة قادرة على خدمة المجتمع وحل المشاكل التي تواجهه في اختصاص الاحياء المجهرية من خلال برنامج الدراسات العليا في الفرع.