يتطلع القسم إلى إعداد كوادر ذات مستوى علمي وفني في تخصص النباتات الطبية والصناعية من خلال دراسة العوامل المؤثرة في نمو هذه المركبات ذات التأثير الطبي وإجراء البحوث والدراسات التي من شأنها تطوير زراعة هذه النباتات في العراق، والتعاون المشترك مع مختلف الدوائر والمؤسسات المعنية بالنباتات الطبية.