يتطلع فرع الامراض وامراض الدواجن الى ان يصبح فرع نموذجي بين كليات الطب البيطري في العراق لغرض الارتقاء بالجانب التشخيصي للامراض البيطرية وكذلك جانب الطب العدلي والتشريح المرضي وامراض الاسماك. حيث يعمل الفرع على تخريج اطباء بيطريين على مستوى عالي من الجانب العلمي والعملي.