تأسس فــــــرع التشــــريح والأنسجـــة والأجنــــة منذ عـــام 1967 م وهو العام المصادف لعام افتتاح هيئـــة الطـب وكــان تحــت أشـــراف كليــة العلــوم آنــذاك وبعد انتقال الكلية إلى مقرها القديم في مستشفى البصرة الجمهوري شكلت النواة الأولى لهذا الفرع في عـــام 1968 م حيث تم بناء مختبر سمـي فـــي حينــه ( مختبر متعدد الأغراض ) حيث تمت فيه التدريسات العملية لمـــواد التشـــريح والأنســـجة والفسلجــة والكيمياء الحياتية وفي بداية عام 1970 م تم أنشـــاء بناية خاصة لفرع التشريح والأنسجــة والأجنــة وفي عام 1979 م أنتقل الفرع إلى بناية المستشفى التعليمي الحالي.