يعد من الفروع العلمية الاولى التي تم افتتاحها منذ تاسيس الكلية ويهدف الى تدريس التشريح العياني والمجهري لاعضاء جسم الحيوان والمقارنة بين الحيوانات المختلفة اضافة الى تطور الاعضاء خلال المدة الجنينية من عمر الحيوان ويشمل الفرع شعب التشريح والانسجة والاجنة ويعتمد التدريس على الجثث الحقيقية والموديلات البالستيكية وعرض الافلام التوضيحية يحوي الفرع مختبرات الدراسات العليا والمواد الكيمياوية ومختبر الدراسات العاليا ومختبرات التشريح للطلبة ومختبر الحيوانات المختبرية ووحدة التصويرالمجهزة بالكاميرات والحاسوب لتصوير الشرائح النسيجية.