ان هدف الفرع هو تخريج اطباء اسنان بكفاءة عالية في مجال جراحة الفم من خلال مناهجه التي تدرس لطلبة الدراسات العليا والاولية والذين سيتمكنون بدورهم من خدمة المجتمع بعد تخرجهم من خلال خدمتهم في مختلف المراكز الصحية المنتشرة في عموم العراق. كما يهدف الفرع الى الارتقاء بالمستوى العلمي من خلال مواكبة التطور الحاصل في العالم في هذا المجال ومن خلال البحوث العلمية واقامة علاقات جيدة مع باقي المراكز الجراحية والجامعات.