يتبنى القسم مشروع إعادة صياغة العقل الإسلامي وبناء عقل إستدلالي علمي عن طريق الإنفتاح على النتاج الفلسفي الإنساني , وإعادة بناء منظومة معرفية فلسفية تربط بين الإيمان والعلم وتعتمد على التراكم المعرفي عبر التاريخ للوصول الى رؤية ايمانية فلسفية علمية معاصرة.