يسعى القسم الى تحقيق جملة اهداف معرفية ومهاراتية والتي من شأنها تزويد الطلبة بالمعلومات العلمية ضمن اختصاصات العلوم الصيدلانية المختلفة والتي تشمل الكيمياء الصيدلانية والطبية وعلم الادوية والسموم وعلم الصيدلانيات والصيدلة السريرية والعقاقير والنباتات الطبية والتحاليل المختبرية والعديد من العلوم الاساسية. كذلك اغناء المناهج الدراسية بالدروس العلمية لاكتساب مهارات وخبرات وتهيئة خريجين كفؤين للعمل في المؤسسات.